Главная » 2014»Август»15 » Скачать Флуоресцентные 5-алкинил-2-дезоксиуридины: синтез, биологическая активность и спектральные свойства в составе ДНК. Скоробогатый, бесплатно
06:32
Скачать Флуоресцентные 5-алкинил-2-дезоксиуридины: синтез, биологическая активность и спектральные свойства в составе ДНК. Скоробогатый, бесплатно
Флуоресцентные 5-алкинил-2'-дезоксиуридины: синтез, биологическая активность и спектральные свойства в составе ДНК
Диссертация
Автор: Скоробогатый, Михаил Валерьевич
Название: Флуоресцентные 5-алкинил-2'-дезоксиуридины: синтез, биологическая активность и спектральные свойства в составе ДНК
Справка: Скоробогатый, Михаил Валерьевич. Флуоресцентные 5-алкинил-2'-дезоксиуридины: синтез, биологическая активность и спектральные свойства в составе ДНК : диссертация кандидата химических наук : 02.00.10 Москва, 2007 137 c. : 61 07-2/314
Объем: 137 стр.
Информация: Москва, 2007
Содержание:
Список сокращений
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА I АЛКИНИЛИРОВАННЫЕ НУКЛЕОЗИДЫ: СИНТЕЗ И ПРИМЕНЕНИЕ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ (обзор литературы)
11 Флуоресцентные алкинилированные нуклеозиды и их производные: методы получения, физико-химические свойства и применение
111 Введение флуоресцентной метки в состав нуклеозидов и их производных при помощи алкинильного линкера
112 Флуоресцентные терминаторы для автоматического секвенирования ДНК
Введение:
В последние годы в химических и биологических исследованиях флуоресцентные метки практически полностью вытеснили радиоизотопные. Такое положение связано с рядом преимуществ флуоресцентных меток - стабильностью, высокой чувствительностью определния (сравнимой с чувствительностью радиоизотопных меток и даже превосходящей ее), возможностью автоматизации процедур модификации и детекции, возможностью одновременного определения нескольких соединений, меченных разными флуорофорами, а также меньшим отрицательным воздействием на окружающую среду.
Очень широкое применение получили флуоресцентные метки в исследованиях нуклеиновых кислот. Однако, в настоящее время их использование в данной области в большинстве случаев ограничивается детекцией олиго- или полинуклеотидной части конъюгатов и намного реже для исследования структурных изменений в процессе различных взаимодействий: гибридизации нуклеиновых кислот с образованием дуплексов или триплексов, взаимодействия с белками, пептидами и смешанными биополимерами. Это вызвано тем, что детекция процессов взаимодействия биомолекул на основе спектров флуоресценции связана с решением ряда проблем: подбор флуоресцентного красителя, разработка синтеза его функционализированного производного, а также нуклеозидных и олигонуклеотидных конъюгатов и исследование их спектральных свойств. Несмотря на все эти трудности, флуоресцентные метки могут служить эффективным инструментом изучения динамики нуклеиновых кислот.
Весьма перспективными флуоресцентными красителями для создания высокочувствительных зондов являются полициклические ароматические углеводороды (ПАУ). Они химически устойчивы, обычно имеют высокие коэффициенты экстинкции и высокие квантовые выходы флуоресценции, способны к нековалентным взаимодействиям с ДНК (интеркаляция, стэкинг, связывание в бороздках дуплексов). Важным и часто используемым свойством ПАУ является их способность к образованию эксимеров (сокращение от excited dimers - возбужденные димеры). Кроме того, ПАУ относительно легко модифицировать с расширением системы л-сопряжения, что может приводить к соединениям, по люминесцентным свойствам резко отличающимся от исходных ПАУ (т. е., к новым красителям).
На основании приведенных данных в качестве красителей нами были выбраны флуорофоры на основе ароматических полициклических углеводородов, сопряженные с нуклеиновыми основаниями, в частности, с основанием 2'-дезоксиуридина. При введении подобных модифицированных нуклеозидов в олигонуклеотид флуоресценция красителя может дополнительно измениться в результате взаимодействия с нуклеиновыми основаниями олигомера. Гибридизация меченного таким образом олигонуклеотида с комплементарной последовательностью может сопровождаться дальнейшими изменениями в спектре флуоресценции метки.
Целью данной работы явился синтез амидофосфитных реагентов на основе флуоресцентных 5-алкинил-2'-дезоксиуридинов, получение модифицированных такими реагентами олигонуклеотидов и изучение физико-химических, спектральных и фотофизических свойств полученных конъюгатов. Отдельной частью работы является исследование биологической активности полученных 5-алкинил-2'-дезоксиуридинов. Мы обнаружили противовирусную активность у таких нуклеозидов, и представляло интерес более подробно изучить взаимосвязь структуры и активности этих соединений.
Настоящая работа выполнена в лаборатории химии нуклеиновых кислот Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
