Главная » 2014»Июль»29 » Скачать Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster. Антоненко, бесплатно
04:50
Скачать Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster. Антоненко, бесплатно
Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster
Диссертация
Автор: Антоненко, Оксана Викторовна
Название: Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster
Справка: Антоненко, Оксана Викторовна. Роль мобильных генетических элементов в отклике на селекцию по количественным признакам у Drosophila melanogaster : диссертация кандидата биологических наук : 03.00.15 / Антоненко Оксана Викторовна; [Место защиты: Ин-т цитологии и генетики СО РАН] Новосибирск, 2008 111 c. : 61 09-3/19
Объем: 111 стр.
Информация: Новосибирск, 2008
Содержание:
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1 Обзор литературы
11 Мобильные генетические элементы
12 Классификация мобильных элементов
13 Мотивы функциональных сайтов МГЭ
14 Индукция транспозиций МГЭ внешними и физиологическими стрессовыми воздействиями
15 Генетические свойства количественных признаков
16 Количественные признаки и мобильные генетические элементы
17 Маркирование локусов количественных признаков ((^ТЬ)
ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
21 Материал
211Линии ВгоБоркИа те1апо^аз1ег
212 Схема изогенизации
22 Методы исследования
221 Схема селекционно-генетических экспериментов
222 Молекулярно-генетические методы
223 Статистическая обработка полученных результатов
ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
31 Разнонаправленная селекция по количественному признаку в гетерогенной линии
32 Разнонаправленная селекция по количественному признаку в изогенной линии после тяжелого температурного шока
33 Разнонаправленная селекция по количественному признаку в изогенной линии после тяжелого температурного шока и в двух повторностях каждого варианта отбора
ГЛАВА 4 ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ВЫВОДЫ
Введение:
Актуальность проблемы. Генетика количественных признаков -традиционное направление классических генетических исследований. В силу необычайно сложной генетической организации количественных признаков это направление исследований пока существенно отстаёт от других классических генетических направлений. Кроме слабой изученности механизмов генетического контроля количественных признаков, также недостаточно изучены пути их онтогенетического формирования, популяционной динамики ответов на прямое и косвенное давление искусственного отбора и роли в эволюции видов. Поэтому в предыдущие десятилетия преобладало два направления в изучении генетики количественных признаков. Один из них - гибридологический анализ, позволяющий оценить характер наследования конкретных количественных признаков и грубо оценить число сегрегирующих генов в конкретном скрещивании, не расчленяя гены на майор-гены и минорные гены. Второй, пожалуй, наиболее широко используемый метод анализа количественных признаков, это генетико-статистический анализ. Однако прогностические способности теоретических генетико-статистических моделей скромны, так как модели построены на упрощениях: они линейны, построены для однолокусной модели детерминации количественного признака и для равновесной популяции. Поэтому статистические гипотезы и генетико-статистические модели всегда имеют характер аппроксимации, т.е. приближенного описания. Поэтому сфера использования параметров, построенных на этих моделях, в практических целях весьма ограничена.
В последнее десятилетие внимание генетиков сосредоточено в основном «на прямом» изучении генетики количественных признаков с использованием как генетических, так и цитогенетических, и молекулярных методов исследования. В ряде лабораторий нашей страны и за рубежом ведутся исследования по анализу систем экспрессии количественных признаков, маркирования локусов, контролирующих проявление количественных признаков (С>ТЪ), анализу участия различных генетических объектов (полигены, мобильные генетические элементы) в фенотипическом проявлении количественных признаков и в ответе на селекционное давление. Однако до настоящего времени в мире имеется достаточно ограниченное количество исследований, посвященных описанию генетики конкретных количественных признаков.
В подобного рода исследованиях, такой объект, как ВгоБорНИа melanogaster, исключительно удобен. Это объект, у которого достаточно сложная организация сочетается с возможностью комплексного изучения генетических, онтогенетических, цитогенетических и популяционных процессов.
Целью исследования являлось выяснение роли мобильных генетических элементов (МГЭ) в геноме Drosoph.Ua melanogaster как участников селекционного процесса по количественному признаку.
Задачи исследования:
Оценить величину изменения среднего фенотипического значения количественного признака (размер проксимального и дистального фрагментов радиальной жилки крыла) в ответ на жесткое селекционное давление в позитивном, направленном на увеличение размеров фрагментов, и негативном, направленном на уменьшение фрагментов, вариантах отбора.
2. Исследовать паттерн мобильных генетических элементов тс1§1 и тс1$2 в исходных линиях до отбора и в финальных поколениях разнонаправленной селекции.
3. Оценить паттерн мобильных генетических элементов mdgl и mdg2 в исходных и финальных поколениях в двух повторностях позитивного и негативного вариантов отбора.
4. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между позитивным (б+) и негативным (б—) вариантами отбора.
5. Оценить коэффициенты корреляции по паттернам двух мобильных генетических элементов в финальных поколениях отбора между повторностями позитивного (Э1+) и (Б2+) и негативного (81-) и (з2-) вариантов отбора.
6. Обсудить гипотезу возможной роли мобильных генетических элементов в ответе популяции БгоБоркИа melanogaster на длительную массовую селекцию по фенотипу количественного признака.
Научная новизна и практическая ценность работы. Для выполнения поставленных задач впервые селекционно-генетический эксперимент был организован таким образом, чтобы были получены аргументы в пользу принятия или отвержения гипотезы об участии мобильных генетических элементов в селекционном процессе. Впервые была осуществлена длительная массовая разнонаправленная селекция по фенотипу количественного признака в двух повторностях каждого селекционного варианта. Впервые показано, что селекция по количественному признаку сопровождалась быстрой фиксацией некоторых сайтов локализации мобильных генетических элементов в одном направлении отбора и элиминацией этих сайтов в противоположном направлении селекции. Впервые продемонстрировано явление синхронного ответа на отбор в двух независимо селектируемых повторностях не только по селектируемому признаку, но по паттерну мобильных генетических элементов. Впервые были оценены коэффициенты корреляции по паттернам мобильных генетических элементов в финальных поколениях селекции между повторностями внутри позитивного и внутри негативного вариантов отбора. Впервые были оценены коэффициенты корреляции по паттернам мобильных генетических элементов в финальных поколениях селекции между вариантом позитивной и негативной селекции. На основании полученных результатов сформулирована гипотеза о возможной роли мобильных генетических элементов в селекционном процессе.
Эти исследования весьма актуальны для понимания механизмов реорганизации генома в ходе отбора, регуляции экспрессии генов, роли МГЭ в селекции и эволюции.
Апробация работы. Основные результаты исследования были представлены на Международной конференции, посвященной современным проблемам радиобиологии, радиоэкологии и эволюции (Дубна, 2000), Второй международной конференции по биоинформатике, структуре и регуляции генома (ВвЯЗ, Новосибирск, 2000), Восьмом 8МВЕ (Афины, США, 2001), на IX Молодежной школе-конференции по актуальным проблемам химии и биологии (Владивосток, 2005), Третьем съезде Вавиловского общества генетиков и селекционеров (Москва, 2004), на Отчетной конференции «Динамика генофондов растений, животных и человека» (Москва, 2005), на Отчетной конференции «Динамика генофондов и биоразнообразие» (Москва,
2007), Международной молодежной конференции «Проблемы молекулярной и клеточной биологии» (Томск, 2007), I Международной конференции «Дрозофила в экспериментальной генетике и биологии» (Харьков, Украина,
2008), а также на Отчетных сессиях Института цитологии и генетики в 2002 и 2005 гг.
Структура и объем работы. Диссертация включает Введение, 4 стандартные главы (Литературный обзор, Материалы и методы, Результаты, Обсуждение), Выводы и Список использованной литературы, состоящий из 222 наименований. Работа проиллюстрирована 12 рисунками и 11 таблицами.
